BOVINOS DA RAÇA CURRALEIRO PÉ-DURO: CARACTERIZAÇÃO GENÉTICA, PREDIÇÃO DE PESO A PARTIR DE MEDIDAS CORPORAIS E AVALIAÇÃO DE CARCAÇA

Abstract

RESUMO GERAL No melhoramento genético de raças nativas como os bovinos Curraleiros Pé-duro (CPD), as intervenções devem ser promovidas com prudência, além do foco nas características produtivas, deve-se considerar o aspecto conservacionista. O objetivo nesta pesquisa foi a partir dos genótipos, elucidar a estrutura e diversidade genética, e a partir dos fenótipos estabelecer equações preditivas de peso baseadas em medidas morfométricas e caracterizar as medidas de carcaça destes. Quatro capítulos, o primeiro uma revisão bibliográfica sistemática e outros três cuja quais foram amostrados folículos pilosos de 474 indivíduos, dados morfométricos de 1023 e medidas de carcaça de 222 animais de diferentes fazendas distribuídas na região Meio-Norte. As amostras biológicas foram submetidas à genotipagem com 17 marcadores microssatélites; em outra investigação os dados morfométricos de altura de cernelha, comprimento corporal, escore corporal, perímetro escrotal, perímetro torácico, sexo e peso vivo compuseram modelos de regressão linear generalizados (GLM) sob três diferentes distribuições combinados à diferentes funções de ligação, submetidos ao StepWise, e a terceira investigação utilizou-se das informações de peso e de carcaça obtidas por ultrassom para obtenção da área de olho de lombo (AOL) e espessura de gordura subcutânea (EGS) na construção das variáveis submetidas a análise de variância em função do sexo dos animais jovens (p-valor <0,05), e o detalhamento por testes de poshoc e modelo de regressão lineares generalizados entre as variáveis peso e AOL. Com relação aos genótipos dos animais amostrados, constatou-se que os marcadores utilizados foram adequados com PIC (Conteúdo de Informação Polimórfica) médio de 0,62; os alelos efetivos foram 4,25 por marcador, com média de heterozigosidades de 0,74 (observado e esperado), sendo menor em um dos rebanhos (0,70) em relação aos demais (0,77 e 0,74). A Análise de Variância Molecular revelou maior taxa de variação dentro dos rebanhos (98,5%) e menor entre os rebanhos (1,5%). Sem diferenças significativas entre os rebanhos, tem-se dois grupos genéticos principais (K=2). As investigações baseadas nos fenótipos possibilitaram a estimação do peso a partir de medidas morfométricas, havendo diferenças no poder de estimação em função das categorias animais. Os resíduos dos modelos não apresentaram distribuição normal (p-valor > 0,05), recorreu-se aos GLM, cuja distribuições mais adequadas por categoria foram: Gamma, Gamma, Inversa Gauseana, Gauseana e Inversa Gauseana, respectivamente para recém-nascidos, crias, recrias, vacas e touros, com RMSE (Raiz do desvio quadrático médio) de 1,22 11,02, 12,25, 22,45 e 19,89 Kg. Os fenótipos obtidos por ultrassom indicam que existem diferenças estatisticamente significativas entre as categorias e fazendas amostradas (p-valor < 0,01), cuja teste SNK indica que peso são diferentes entre todas as categorias (p<0,05), em que a AOL100 dos CPD ao sobreano é minimamente adequada, em média 19,6 e 17,9 cm2/ 100 Kg, respectivamente para garrotas e garrotes. As investigações promovidas indicam que os Curraleiro Pé-duro apresentam alta diversidade e pouca estrutura genética, não sendo influenciada pela distância geográfica (α=0,05); os modelos GLM são adequados para estimar o peso dos bovinos nas diferentes categorias; e de forma geral os bovinos CPD apresentaram diminuta EGS, mas satisfatória AOL, compatível com raças especializadas em produção de carne.

ABSTRACT When it comes to the genetic improvement of native breeds such as Curraleiro Pé-duro (CPD) cattle, interventions must be carefully promoted, in addition to focusing on productive traits, and considering the conservationist aspects. The objective of this research was to elucidate the structure and genetic diversity of the genotypes, and from the phenotypes, establish predictive weight equations based on morphometric measurements, and lastly to characterize their carcass measurements. This work is divided into four chapters. The first consists in a systematic literature review and the other three shows hair follicles from 474 individuals that were sampled, morphometric data from 1023 and carcass measurements from 222 animals from different farms distributed in the Mid-North region. Biological samples were submitted to genotyping with 17 microsatellite markers; in another investigation, the morphometric data of withers height, body length, body score, scrotal perimeter, thoracic perimeter, sex and weight composed generalized linear regression models (GLM) under three different distributions. They were combined with different linkage functions and submitted to StepWise. The third investigation used the information on weight and carcass obtained by ultrasound to get the rib eye area (AOL) and subcutaneous fat thickness (EGS) in the construction of variables submitted to analysis of variance depending on the sex of the animals. young animals (p-value <0.05), and detailing by post hoc tests and generalized linear regression model between the variables weight and AOL In relation to the genotypes of the sampled animals, it was found that the markers used were adequate with an average PIC (Polymorphic Information Content) of 0.62; the effective alleles were 4.25 per marker, with a mean heterozygosity of 0.74 (observed and expected), being lower in one of the herds (0.70) compared to the others (0.77 and 0.74). Molecular Variance Analysis revealed a higher rate of variation within herds (98.5%) and lower between herds (1.5%). Without significant differences between herds, there are two main genetic groups (K=2). Investigations based on phenotypes made it possible to estimate weight from morphometric measurements, with differences in estimation power depending on animal categories. The residuals of the models did not present a normal distribution (p-value > 0.05), so the research resorted to GLM, whose most appropriate distributions per category were: Gamma, Gamma, Inverse Gausean, Gauseana and Inverse Gauseana, respectively for newborns, offspring, cows and bulls, with RMSE (Root Mean Square Deviation) of 1.22 11.02, 12.25, 22.45 and 19.89 Kg. The phenotypes obtained by ultrasound indicate that there are statistically significant differences between the sampled categories and farms (p-value < 0.01), whose SNK test indicates that weight are different between all categories (p<0.05). The AOL100 of yearling CPD is minimally adequate, on average 19.6 and 17.9 cm2/100 kg, respectively for withers and withers. The investigation indicate that Curraleiro Pé-duro has high diversity and little genetic structure, not being influenced by geographic distance (α=0.05); GLM models are suitable for estimating the weight of cattle in different categories; and in general, the CPD cattle showed a small EGS, but a satisfactory AOL, compatible with breeds specialized in meat production.