TRIAGEM E VALIDAÇÃO DE SNPS PARA USO EM SELEÇÃO ASSISTIDA POR MARCADORES MOLECULARES EM OVINOS SANTA INÊS

Abstract

RESUMO: No Brasil, a demanda por carne ovina é superior à sua produção, levando à necessidade de importação desse produto. A ausência de programas de melhoramento definidos justifica o déficit na produção e indica a necessidade de esforços em pesquisas que busquem o aumento da produtividade. Objetivou-se com este trabalho identificar polimorfismos do tipo SNP em sequências de genes candidatos para características de medidas corporais e de desenvolvimento de carcaça em ovinos. Foram coletadas informações de área, comprimento e profundidade de olho de lombo, altura da garupa, comprimento corporal, circunferência torácica, altura da cernelha, altura da pata, profundidade torácica e comprimento da garupa em 293 animais de ambos os sexos. Onze genes candidatos foram selecionados na literatura (RPL26, SLC2A4, DVL2, CHRNB1, TP53, POLR2A, CTC1, PIK3R5, MYH10, NCAPG e LCORL), para a triagem de SNPs, visando sua genotipagem com técnicas de PCR-RFLP. Os polimorfismos presentes foram associados aos fenótipos dos animais amostrados por meio de análises de regressão. Dos genes avaliados, apenas o LCORL mostrou polimorfismo com sítio de restrição para a enzima BsrI, a qual pôde ser utilizada para genotipar as variáveis Adenina e Guanina, na posição 149.731. Os resultados mostraram que esse SNP é uma mutação não sinônima que causa a substituição do aminoácido Serina, na posição 417, por uma Glicina no peptídeo codificado. As análises estatísticas apontaram que as variáveis genotípicas estão significativamente associadas a medidas de tamanho corporal e de qualidade de carcaça em ovinos da raça Santa Inês. As medias de área, comprimento e profundidade de olho de lombo, altura da garupa, comprimento corporal e circunferência torácica apresentaram diferenças significativas para os diferentes genótipos. O genótipo com menor frequência nos rebanhos estudados (f(GG) = 0,018) apresentou maiores valores médias para todas essas características. ABSTRACT: In Brazil, the demand for sheep meat is higher than its production, leading to the need of importing this product. The absence of specific improvement programmes justifies the production deficit and indicates the necessity of efforts in research that look into increasing productivity. This work is aimed at identifying polymorphisms of the SNP type in gene sequences candidates for features of body measurements and carcass development in sheep. Information on area, length and depth of loin eye, croup height, body length, thoracic circumference, height of the withers, paw height, chest depth and croup length were collected in 276 animals from both sexes. Eleven candidate genes were selected for the work (RPL26, SLC2A4, DVL2, CHRNB1, TP53, POLR2A, CTC1, PIK3R5, MYH10, NCAPG and LCORL) for the screening of SNPs for genotyping with PCR-RFLP techniques. The present polymorphisms were associated to the phenotypes of the animals sampled by means of regression analysis. Out of the genes evaluated, only LCORL showed restriction polymorphism for the BsrI enzyme, which could be used to genotype the Adenine and Guanine variables at position 149731. The results showed that this SNP is a non-synonymous mutation that causes the substitution of the amino acid Serine at position 417 by a Glycine in the encoded peptide. Statistical analysis indicated that the genotypic variables are significantly associated to the measures of body size and carcass quality in Santa Inês sheep. The measures of the area, length and depth of loin eye, croup height, body length and thoracic circumference presented meaningful differences for the different genotypes. The genotype with lower frequency in the studied flocks (f(GG) = 0.018) showed higher mean values for all these characteristics.