TAXONOMIA, SISTEMÁTICA E GENÉTICA POPULACIONAL DO CARANGUEJO-UÇÁ, UCIDES CORDATUS: desenvolvimento de ferramentas moleculares e inferências filogenéticas

Abstract

RESUMO: O caranguejo-uçá, (Ucides cordatus(Linnaeus, 1763), é uma espécie pertencente à família Ocypodidae e representa um dos mais importantes componentes da fauna dos manguezais, tem grande importância econômica e ecológica para as áreas de manguezal do Brasil. O objetivo desse trabalho foi estudar a sistemática molecular e estrutura genética populacional do caranguejo-uçá, Ucides cordatus, tendo em vista o fornecimento de subsídios à sua exploração racional como medida para permitir a sustentabilidade do recurso, e a maximização de aproveitamento do potencial já explorado do caranguejo de mangue. Foram desenhados primers nas regiões adjacentes à região controle isolaram a mtDNA do Ucides cordatus (Decapoda, Brachyura); e realizados os sequenciamento da RC do mtDNA.As regiões hipervariáveis também foram amplificadas com sucesso, HV1 (637 pb) e HV2 (445 pb). A regiçao controle do DNAmt em U. cordatus mostrou ser altamente polimórficas em as suas extremidades 5 'e 3' .Avaliamos as relações entre U. cordatus cordatus e U. cordatus occidentalis usando sequências de nucleotídeos do RNA ribossômico de subunidade grande (LSUrRNA ou 16S), citocromo oxidase I (COX-1) e também citocromo b (Cyt -b) do genoma mitocondrial como caracteres moleculares para inferência de relações filogenéticas. livre da influência ambiental. As matrizes de distância evolutiva foram calculadas a partir de dados de seqüência de DNA. As árvores filogenéticas foram inferidas com base nessas seqüências de nucleótidos. Foi obtido um forte apoio filogenético que suporta uma filogenia bem resolvida do grupo Thoracotremata. O uso de genes codificadores de proteínas na reconstrução de filogenia também provou ser útil. Avaliamos a distribuição espacial da diversidade genética e das taxas de migração (fluxo genético) entre as populações de Ucide cordatus no Brasil. Os loci foram altamente polimórficos, com média de 12 alelos por locus. Apesar da alta variabilidade genética, observou-se uma falta de diferenciação populacional de acordo com os valores de FST (média = 0,016) e análise bayesiana. As altas taxas de migração encontradas entre as populações (~ 17,2 migrantes efetivos por geração entre cada par de população) parecem ser a principal força que atua para sustentar a distribuição homogênea da diversidade genética entre as populações. Esses achados são vitais para o estabelecimento de uma base de dados a ser usada no desenvolvimento de programas de conservação para a espécie. ABSTRACT: The crab-uçá, Ucides cordatus (Linnaeus, 1763), is a species belonging to the family Ocypodidae and constitutes one the important components of mangroves fauna. It has great economic and ecological importance for the mangrove areas of Brazil. The objective of this work was to study the molecular systematics and population genetic structure of the crab-uçá, Ucides cordatus, in order to provide subsidies to its rational exploitation as a measure to allow the sustainability exploitation of the potential of the mangrove. .Primers designed in the regions adjacent to the control region isolated the mtDNA-CR from the Ucides cordatus (Decapoda, Brachyura); and the sequencing of mtDNA-CR was performed. Hypervariable regions were also successfully amplified, HV1 (637 bp) and HV2 (445 bp). The RC of mtDNA in U. cordatus showed to be highly polymorphic at its 5 'and 3' ends. We evaluated the relationships between U. cordatus cordatus and U. cordatus occidentalis using nucleotide sequences of large subunit ribosomal RNA (LSUrRNA or 16S), cytochrome c oxidase I (COX-1) and also cytochrome b (Cyt-b) from the mitochondrial genome as molecular characters for inference of phylogenetic relationships. free from environmental influence. The matrices of evolutionary distance were calculated from DNA sequence data. Phylogenetic trees were inferred based on these nucleotide sequences. A strong phylogenetic signal was obtained that supports a well resolved phylogeny of the Thoracotremata group. The use of protein-encoding genes in the reconstruction of phylogeny has also proved useful. We evaluated the spatial distribution of genetic diversity and migration rates (gene flow) among populations of ucides cordatus in Brazil. The loci were highly polymorphic, with a mean of 12 alleles per locus. Despite the high genetic variability, a lack of population differentiation was observed according to the values of FST (mean = 0.016) and Bayesian analysis. The high migration rates found among populations (~ 17.2 effective migrants per generation between each pair of population) appear to be the main force that supports the homogeneous distribution of genetic diversity among populations. These findings are vital for the establishment of a database to be used in the development of conservation programs for the species.